A vízügyi igazgatóságok a védelem, vízgazdálkodás, vízrajz és vízrendezés körében látnak el feladatokat. Ezek a szervek foglalkoznak így többek között árvízvédelemmel, vízminőség-védelemmel, vízgyűjtő-gazdálkodással, vízhozam-méréssel és folyószabályozással.

Országos szinten az Országos Vízügyi Főigazgatóság jár el: http://www.ovf.hu/hu/

Területi szinten tizenkét, a víztározó területekhez igazodó területi vízügyi igazgatóság jár el: http://www.ovf.hu/hu/vizugyi-igazgatosagok